ITK 4.0にアップデートされてImageToImageFilterが変更されていました．
変更点は画像を2個入力した場合に，Origin，Spacing，Directionが同一かのチェックが入るようになりました．
本来であれば，正しいチェックなのですが使用するツール（例えばIRTK）によってはOriginやDirectionが勝手に変更されるものもあるため，その場合は注意が必要です．
今までは単に各軸方向の画素数が一緒であればボクセル単位のフィルタ処理を適用できたのですが，4.0以降では上記の3項目を同一にしておく必要があります．
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